Caricare pacchetti in r

Caricare pacchetti in r
“La creazione di pacchetti è un buon modo per rendere il tuo lavoro/codice/programma organizzarlo e condividerlo con gli altri in modo che possano riutilizzarlo. Codice, set di dati, documentazione di tali funzioni utilizzate all'interno del pacchetto e alcuni test sono contenuti da un pacchetto. Possiamo scaricare e installare i pacchetti dai repository. Un repository è una posizione o una piattaforma per archiviare i pacchetti in modo che chiunque possa usarli dopo l'installazione. Organizzazioni e sviluppatori hanno ciascuno il proprio repository locale, che di solito è online e aperto al pubblico. Cran, bioconduttore e github sono alcuni dei più importanti repository di pacchetti R."

Cosa sono i pacchetti nel linguaggio di programmazione r in Ubuntu 20.04?

È una raccolta di campioni di dati, funzioni R e script di compilazione. Questi pacchetti si trovano nella directory nell'ambiente R, noto come biblioteca. Un set di pacchetti è installato da R durante il processo di installazione. I pacchetti possono essere aggiunti in seguito se sono richiesti per una funzionalità o uno scopo specifici. Quando iniziamo la console R, i pacchetti predefiniti saranno disponibili solo per l'uso. Per utilizzare i pacchetti che sono già stati installati nel nostro sistema, dobbiamo caricarli esplicitamente.

Come caricare e utilizzare i pacchetti in linguaggio di programmazione R in Ubuntu 20.04?

È necessario prima installare e quindi caricare un pacchetto nella libreria R prima di poterlo utilizzare. La libreria è una directory in cui vengono caricati i pacchetti della sessione R corrente. I pacchetti devono essere caricati nella libreria per ogni sessione.

Di seguito sono riportati alcuni esempi in cui vedremo come installare i pacchetti in R in modo che possano essere caricati per l'uso nel linguaggio di programmazione R

Esempio 1: installazione di pacchetti R

Esistono diversi modi per installare i pacchetti in R. Ne discuteremo solo alcuni in questo esempio.

Installazione da cran

Cran è l'acronimo di completa rete di archivio r. È il repository ufficiale della comunità R, che viene aggiornato regolarmente. Per essere accettato in cran, un pacchetto deve superare una serie di test per garantire che sia conforme alle regole e alle politiche di Cran. Per installare un pacchetto da Cran, dovresti conoscere il nome di quel pacchetto, in modo da poterlo usare nel comando seguente.

Il compilatore avvia il processo di installazione premendo Invio dopo il comando sopra. Più pacchetti possono essere installati alla volta. Per questo, scriveremo i nomi dei pacchetti come vettore di personaggi.

Installazione dal bioconduttore

Il modo standard di installare un pacchetto dal bioconduttore è passare il seguente URL all'interno della funzione di origine.

Ciò installerà la funzione necessaria per installare pacchetti di bioconduttori. Dopo aver installato la funzione richiesta, puoi semplicemente scrivere il nome dei pacchetti di bioconduttori o il vettore dei caratteri dei loro nomi all'interno della funzione Vioclite ().

Installazione da GitHub

Il pacchetto R devTools può essere utilizzato per installare un pacchetto da GitHub. Aiuterà gli utenti fornendo le funzioni necessarie per semplificare le attività comuni in R.

Le istruzioni successive possono essere utilizzate per installare pacchetti GitHub. È possibile dare un percorso al posto di "package_path" per installare il pacchetto richiesto.

Esempio 2: caricamento di pacchetti R

Dopo aver finito con l'installazione di pacchetti nell'ambiente R, per rendere utili i pacchetti, dobbiamo caricarli in R per la sessione corrente.

Il comando Library () può essere utilizzato per caricare il pacchetto di lingua R, come mostrato di seguito:

È possibile scrivere il nome del pacchetto richiesto all'interno della funzione della libreria se è necessario caricare un pacchetto precedentemente installato ma non è disponibile nell'ambiente che stiamo utilizzando. Il seguente comando viene utilizzato per caricare un pacchetto.

Qui lib () è una funzione che viene utilizzata per fornire il percorso della libreria in cui i pacchetti R installati sono situati/memorizzati. Per caricare un file nella sessione corrente, utilizzeremo le istruzioni di seguito.

Nell'installazione.pacchetti () specificheremo il percorso del nostro pacchetto in cui si trova il nostro pacchetto. Se dobbiamo solo accedere ad alcune funzioni o dati all'interno di un pacchetto su base occasionale, possiamo utilizzare il seguente comando.

Nell'esempio sopra, useremo il nome del pacchetto da cui vogliamo utilizzare una funzione specifica e scriveremo il nome della funzione nel luogo di "function_name ()."

R consente inoltre di scaricare un pacchetto dalla sessione corrente utilizzando il comando Detach ().

Esempio 3: Gestione dei pacchetti R

In R, puoi utilizzare alcuni comandi per aiutarti a gestire i pacchetti utilizzati e installare. Possiamo anche vedere quali pacchetti sono disponibili, nonché quali pacchetti sono installati e caricati nel nostro ambiente. Possiamo verificare gli aggiornamenti disponibili e assicurarci che siano aggiornati. Il comando successivo mostra un elenco dei pacchetti R caricato nella sessione corrente utilizzando Search ().

Per verificare quali pacchetti sono installati nel nostro sistema, useremo installati.comando pacchetti ().

Fornirà una matrice con una riga per ogni pacchetto e colonne per informazioni sui pacchetti come percorso della libreria, versioni, dipendenze, dettagli di licenza e così via.

I pacchetti installati possono essere aggiornati utilizzando l'aggiornamento.comando pacchetti ().

Se non scriviamo il nome del pacchetto nel comando, controllerà tutti i pacchetti nel nostro sistema per aggiornarli.

Possiamo anche eliminare un pacchetto dal nostro sistema utilizzando Rimuovi.comando pacchetti ().

Scriverai il nome del pacchetto nel comando sopra per eliminarlo dal sistema.

Conclusione

In questo articolo, abbiamo cercato di insegnarti il ​​concetto di base dei pacchetti R e come puoi usarli nel linguaggio di programmazione R in Ubuntu 20.04. Ora, dovresti essere in grado di installare pacchetti e caricarli sul sistema. Abbiamo implementato alcuni esempi in questo tutorial per spiegarti come installare pacchetti da diversi tipi di repository, come puoi caricarli nella sessione corrente, come staccarli, come controllare i pacchetti installati sul sistema, come aggiornare loro e come rimuovere i pacchetti dal sistema che non sono più richiesti.